Prestasi terbaik Timnas Indonesia di Piala Asia U17 adalah menempati posisi empat pada edisi tahun 1990.
Saat itu, Indonesia lolos ke semifinal setelah menempati peringkat kedua Grup B. Di semifinal, Indonesia menyerah 2-0 dari Uni Emirat Arab.
Dalam perebutan tempat ketiga sekaligus tiket lolos ke putaran final Piala Dunia U17 1991, Indonesia takluk dengan skor telak 5-0 dari China.